哲三在缠斗中受了重伤，逃进了阉割房。虽然过追捕，但却又阴错阳差、被当成未净身的准太监，在受伤无力抵抗下、被五花大绑上了手术台。但没想到执刀的张师父因为伤风向天心求诊，忘了吃药不能喝酒。张师父头昏眼花、下刀失了准，哲三保住了命根子。不过因为身受重伤、无力逃跑。最危险的地方就是最安全的地方，于是哲三将计就计，假冒太监，躲入皇宫。 　　天心刚闯祸，马上被大娘下令禁足，在猪肉摊旁严加看守，忽然市集来了大批官兵，颁来圣旨，宣天心进太医院当实习院士。天心、大娘两人面面相觑、不明原因。 　　天心为了要进太医院，答应了大娘三个要求「非病不理、非民不亲、男装入宫」，这才了了天心多年来的心愿，进了太医院。 　　天心在太医院受到冷泉为难，成了清洁工，忙了一天的天心，居然在洗澡的时候跟哲三「坦诚相见」。哲三为了蒙混过关，慌称自己是皇上的「密探」，两人互相承诺不说出彼此的秘密。哲三也因为这次，对天心一见倾心。 　　朱历要保川整饬东厂贪官污吏，捉拿飞贼，交给赵甫嵩处理。保川搬出太后，还找来朱历的表妹云莺来，企图牵制朱历，母命难违，朱历只好带着她去玩。但朱历不知道，其实云莺别有目的…

• 第1集：天心参加院士考试，却…
• 第2集：哲三在缠斗中受了重伤…
• 第3集：朱历硬着头皮陪表妹放…
• 第4集：行刑当日，天心、哲三…
• 第5集：保川要天心治疗太后的…
• 第6集：大娘提醒天心，最近因…
• 第7集：天心一回宫，发现选进…
• 第8集：保川为了让云莺中选，…
• 第9集：太后限定的期限已到，…
• 第10集：天心却为了发现朱历的…
• 第11集：一行人回京后，朱历马…
• 第12集：甫嵩接获消息，皇上、…
• 第13集：李保川得知消息后，心…
• 第14集：大娘被抓了，天心在小…
• 第15集：原来这是朱历和哲三想…
• 第16集： 天心好不容易得到哲…
• 第17集：苡柔为了尽速实现当上…
• 第18集：苡柔亲切的带着大娘、…
• 第19集：天心要龄春去太医院帮…
• 第20集：云莺一死，天心怀疑是…
• 第21集：朱历倍感压力，苡柔这…
• 第22集：正在庙里替天心祈福的…
• 第23集：朱历向太后禀告侦办结…
• 第24集：哲三为了报复湘凝，将…
• 第25集：湘凝为了救哲三，前去…
• 第26集：朱历为了证明自己对天…
• 第27集：太后经过冷泉的治疗，…
• 第28集：保川对苡柔说道，他在…
• 第29集：天心无法对外求援，于…
• 第30集：朱历找来哲三，对哲三…
• 第31集：朱历前来找天心，希望…
• 第32集：天心、哲三两人回去找…
• 第33集：保川拿着追捕天心时，…
• 第34集：保川要苡柔去探听朱历…
• 第35集：大娘将本草一书交给了…
• 第36集：本草一书已经确认编撰…
• 第37集：虽然天心被层层戒护，…
• 第38集：李保川一死、朱历便从… 完